Desarrollos de marcadores moleculares específicos para diferentes grupos de cebacinales (basidiomycota) micorrizicos en ericáceas a partir del análisis de secuencias de DNA ribosomal

Abstract:

El uso de marcadores moleculares acelera los programas de mejoramiento genético, en el sentido que estos pueden suplantar los tradicionales marcadores morfológicos o fenotípicos, en especial cuando la expresión de ésta característica es ambientalmente inestable y difícil de observar. Los marcadores moleculares son utilizados para identificar grupos de genes o loci. La investigación tuvo como objetivo desarrollar un marcador molecular localizado en el rDNA de un cierto grupo de hongos llamados sebacinales. Las técnicas moleculares nos permitieron realizar dicho trabajo, entre ellas la extracción del DNA, amplificación del rDNA, PCR donde se utilizaron diversos primers específicos para Sebacinales: NS23, MWS1628, SebITS3, MWS1467 y SSNS691 y un primer universal ITS1F, el cloning y templiphi. Se amplificó la secuencia 18S, 5.8S-ITS, 28S rDNA, estos productos fueron analizados por medio de electroforesis y finalmente secuenciados. Las secuencias fueron analizadas en orden en el programa enzymex, para encontrar enzimas de restricción adecuadas y que corten específicamente a las sebacinales. Se localizó algunos sitios para marcadores en la 28S rDNA, sin embargo solo una enzima de restricción, Bstnll pudo ser identificada. Bstnll podría ser aplicada para TRFLPs para el análisis de sebacinales. Dentro de esta región encontramos secuencias específicas, pero no encontramos enzimas de restricción para dichas secuencias. Se propone utilizar estas secuencias para la realización de oligonucleótidos. Utilizando el gen nuclear ribosomal (18S, 5.8S-ITS, 28S) de secuencias de las Sebacinales se encontraron nueve (Aaul, Aval, Aflll, Afllll, Bstul, Drdl, Eael, Styl, Msll) enzimas de restricción para RFLP. Tanto los RFLP y TRFLP encontrados en esta investigación, quedan tentativamente para ser utilizados para screening en Sebacinales.

Año de publicación:

2010

Keywords:

• TRFLPs
• RDNA templiphi
• RFLPs
• ENZIMAS DE RESTRICCIÓN

Fuente:

rraae