Determinación de la diversidad de actinomicetes aislados de ecosistemas glaciares de los Andes y la Antártida

Abstract:

Se identificaron molecularmente 152 cepas de actinomicetes aisladas de ecosistemas fríos de la Antártida, Cotopaxi y Chimborazo. A través de la amplificación de los patrones de fingerprinting por rep-PCR, utilizando el primer BOX A1R1, se logró construir el dendrograma genotípico generado mediante el coeficiente de Pearson y el algoritmo UPGMA, obteniendo 23 grupos-especie. El análisis filogenético del gen del ADNr 16S fue construido mediante el cálculo de las distancias evolutivas de Jukes & Cantor y el algoritmo de Neighbour – Joining. Se logró identificar 4 especies diferentes, que pertenecieron al género Streptomyces, mientras que la cepa DE-067 estuvo asociada al género Nocardia. Por otra parte, mediante la caracterización fenotípica se determinó que la mayoría de las cepas de este estudio resultaron ser mesófilas, halófilas débiles y neutrotolerantes. Además, poseen una gran capacidad de metabolizar aminoácidos como fuente de carbono y nitrógeno. Con los resultados obtenidos, se construyó el dendrograma fenotípico mediante el coeficiente SSM y el algoritmo UPGMA, determinando 23 grupos-especie a un 89% de similitud. Posteriormente, se realizó la identificación molecular de la colección mediante el gen del ADNr 16S, con las cepas que compartían patrones de fingerprinting similares a las especies identificadas. Logrando posicionar taxonómicamente a 87 cepas, en 14 grupos-especie al 80% de similitud. Como es evidente, se necesita complementar los resultados obtenidos en este estudio, mediante la identificación molecular de las cepas que no se secuenciaron, para conocer con certeza la diversidad de actinomicetes en la colección.

Año de publicación:

2019

Keywords:

• ECOSISTEMAS FRÍOS
• TAXONOMÍA POLIFÁSICA
• Actinomicetes
• CARACTERIZACIÓN GENOTÍPICA
• Caracterización fenotipica

Fuente:

rraae