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Diversidad genetica del cacao Nacional ecuatoriano del banco de germoplasma de Tenguel-Guayas, Ecuador, con base en SNP'S.

Abstract:

Se estudió la diversidad genética y estructura de 80 introducciones de Theobroma cacao L.'Nacional'existente en la finca" La Buseta", Tenguel-Guayas, Ecuador. La caracterización incluyó 19 controles y 96 marcadores de polimorfismo de nucleótidos simples (SNP), en la plataforma del sistema Fluidigm EP1. Los SNP's mostraron información polimórfica de 0,289 y 0,395; con heterocigosidad observada de 0,479 y esperada de 0,378. Se obtuvieron los perfiles genéticos de las introducciones, a partir de los cuales se identificaron 16 grupos de introducciones idénticas. El análisis de probabilidad de identidad, incluyendo hermanos (PIsib), concluyó que los SNP's fueron suficientes para diferenciar las introducciones. El promedio de heterocigosidad de las muestras fue de 0,432 siendo mayor en el grupo F (0,646) y menor en el grupo P (0,253). Los controles de genotipeo Criollo y Contamana, mostraron mayor …