Identificación de bacterias aisladas de ecosistemas glaciares, andinos y antárticos

Abstract:

Se identificaron bacterias aisladas de ecosistemas glaciares, Andinos y Antárticos. Mediante rep-PCR usando el primer BOX, se logró caracterizar genotípicamente 72 cepas y se construyó un dendrograma por taxonomía numérica, usando el coeficiente de Pearson y el algoritmo de UPGMA, obteniendo la formación de 10 grupos. A partir de estos, fueron seleccionados representantes para el secuenciamiento del gen del ADNr 16S y caracterización fenotípica. El análisis filogenético del gen del ADNr 16S se realizó mediante el cálculo de las distancias evolutivas de Jukes & Cantor y el algoritmo de Neighbour-Joining, permitiendo identificar 11 especies distintas. De las cuales, las cepas DG-222 y DG-203 probablemente pertenezcan a especies nuevas. Sin embargo, es necesario realizar estudios posteriores para demostrar esto. Mediante la caracterización fenotípica se construyó un dendrograma de taxonomía numérica de datos fenotípicos utilizando el coeficiente SSM y el algoritmo UPGMA, obteniendo la formación de 21 grupos fenéticos al 84,6% de similitud. La mayor parte de la colección se determinó como Gram negativa, psicrótrofa, neutrotolerante, halófila débil o halófila. Además, se descubrió nuevas características fisiológicas de 4 especies distintas. El análisis de taxonomía polifásica con las cepas que tuvieron patrones de fingerprinting similares a las especies identificadas, logró ubicar 35 cepas en función a la caracterización molecular. Formando 16 grupos fenéticos al 90% de similaridad y determinando la posición taxonómica polifásica del 48,6% de la colección. Probablemente, la diversidad de la colección se encuentra subestimada y podrían existir especies que no se han identificado en este estudio. Es necesario realizar un segundo análisis de las cepas que fueron excluidas en los análisis.

Año de publicación:

2019

Keywords:

• FILOGENIA BACTERIANA
• COMUNIDADES MICROBIANAS GLACIARES
• TAXONOMÍA POLIFÁSICA
• ECOSISTEMAS FRÍOS
• TAXONOMÍA NUMÉRICA

Fuente:

rraae