Regresar

Assessment of genetic diversity of Smallanthus sonchifolius (Poepp. & Endl.) h. Robinson landraces by using AFLP markers

Abstract:

AFLP (Polimorfizam amplifikovanih dutina fragmenata) analiza je uraDena na Smallanthus sonchifolius u cilju proučavanja genetičkog diverziteta. To je etnomedicinska jestiva biljka autohtona u Peruu i kultivisana u mnogim drugim zemljama. Trinaest populacija je analizirano odabranim AFLP kombinacijama prajmera, koji su dali ukupno 185 fragmenata, od kojih je 180 bili polimorfno (97.00% polimorfizma). Prosečan broj fragmenata po kombinaciji prajmera bio je 37, ali kombinacija MseI (M)-CAG/EcoRI (E)-ACT je imala najveci broj od 63 amplikona, dok je kombinacija M-CAG/E-ACC imala samo 27. OdreDene su osobine markera kao što su snaga (RP), marker indeks (MI) i sadrtaj informacija o polimorfizmu (PIC). RP je varirao od 11.54 (M-CAG/E-ACC) do 27.54 (M-CAG/E-ACT), PIC od 0.25 (M-CAG/E-AGC) do 0.28 (M-CAG/E-ACA), dok je MI bio u rasponu od 6.18 (M-CAG/E-ACC) do 15.95 (M-CAG/E-ACT). Klaster i PCA analiza primenjene su za utvrDivanje meDuzavisnosti jakon populacija. aključili smo da su AFLP markeri pokazali najvecu efikasnost u proceni geneticke raznovrsnosti kod jakona.