Caracterizaci?n molecular de 42 accesiones de la colecci?n de genotipos de cacao nacional (Theobroma cacao L.) de la EET Pichilingue, INIAP, mediante el uso de marcadores microsat?lites (SSRs)


Abstract:

El cacao (Theobroma cacao L.) es un cultivo importante para la econom?a de paises de clima tropical; especialmente para el Ecuador por su tradicion fina cacaotera. Debido a que las accesiones de cacao deben ser porpagadas vegetativamente, para conservar su integridad genetica, su germoplasma se mantiene en colecciones vivientes en campo; lo cual se ha convertido en un problema debido a la presencia de accesiones duplicadas, errores extraclonales, y en ?rboles mal identificados en determinadas accesiones, es decir errores intraclonales. Por este motivo los estudios en base a biolog?a molecular son de vital importancia para el establecimiento y mantenimiento de importantes colecciones de T. cacao. En el presente trabajo, se estableci? el uso de 20 microsat?lites para realizar el genotipaje, usando la tecnolog?a M13 tailing junto con el equipo LI-COR 4300S, para caracterizar y generar el perfil gen?tico de 400 ?rboles pertenecientes al Bloque I de la CGN (Colecci?n de Genotipos de Cacao Nacional) en la EET Pichilingue del INIAP. Cuarenta y dos accesiones fueron caracterizadas molecularmente, encontr?ndose que no existen errores extraclonales; sin embargo se hall? un alto n?mero de errores intraclonales. Del total de accesiones en estudio el 71.42% present? al menos 1 error intraclonal, mientras que el 28.58% no presentan ning?n error. Adem?s entre los 400 individuos analizados, se encontr? que el 21.5% present? un perfil gen?tico distinto, cayendo dentro de los errores intraplanta. Esta investigaci?n permiti? determinar una medida de diversidad g?nica (He) de 0.616; un promedio de 6.15 alelos por marcador molecular utilizado y un contenido promedio de informaci?n de polimorfismo (PIC) de 0.558. Los resultados obtenidos resaltan la importancia que tiene la inclusi?n de la biolog?a molecular para el establecimiento, mantenimiento y depuraci?n de las colecciones de germoplasma, no solo del Ecuador sino a nivel mundial. De esta manera se espera aportar m?s herramientas tecnol?gicas para el fitomejoramiento de un cultivo tan importante como el cacao.

Año de publicación:

2014

Keywords:

  • BIOLOG?A MOLECULAR
  • CCAT
  • MICROSAT?LITES
  • Diversidad
  • GENOTIPAJE
  • Germoplasma
  • Theobroma cacao L.

Fuente:

rraaerraae

Tipo de documento:

Bachelor Thesis

Estado:

Acceso abierto

Áreas de conocimiento:

  • Genética

Áreas temáticas:

  • Bioquímica
  • Ecología
  • Temas específicos de la historia natural de las plantas