Clasificación del poder edulcorante de moléculas naturales y sintéticas mediante aplicación de métodos QSAR

Abstract:

En este trabajo se presenta un estudio de la Relación Cuantitativa Estructura-Dulzor Relativo (QSRSR) en un set de 100 compuestos edulcorantes naturales y sintéticos, cuyos valores de Dulzor Relativo (RS) respecto a la sacarosa han sido reportados en la literatura. Usando estos valores se dividió la respuesta en 3 clases mediante cuartiles, es decir, edulcorantes con RS menor o igual a 1 (Primer cuartil, Clase 1), sustancias con dulzor mayor que 1 y menor que 325 (Segundo cuartil, Clase 2) y las estructuras con RS superior a 325 (Tercer cuartil, Clase 3). Las estructuras moleculares se usaron para calcular 4885 descriptores moleculares usando el programa Dragon, los cuales posteriormente se redujeron a 586 al eliminar los descriptores constantes y los correlacionados entre sí al 90%. Entonces, la base de datos se dividió aleatoriamente en dos subconjuntos, de calibración (60%) y de pbkp_redicción (40%), respetando la numerosidad de las clases establecidas. Usando el conjunto de calibración, se aplicó la metodología de selección de variables de algoritmos genéticos (GA-VSS), en el cual se incorporó la Función de Deseabilidad para optimizar dentro del método de clasificación de los vecinos más cercanos (k-NN) los siguientes parámetros: 1) el número k de vecinos, 2) la tasa porcentual de no error (NER) y 3) el número de descriptores introducidos en el modelo (principio de parsimonia). Este proceso se repitió secuencialmente en tres particiones diferentes, para posteriormente unir los descriptores seleccionados y aplicar nuevamente los GA-VSS para establecer el modelo final con 6 descriptores. Los parámetros de calibración …

Año de publicación:

2014

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